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环境微生物功能基因的定量检测

作者:小编 更新时间:2022-04-24 点击数:

        在环境中,微生物起到了重要的作用,而这些作用往往是由微生物的相关功能基因来决定的。比如,氮循环相关功能微生物在土壤发挥其生态功能中起着重要的作用,固氮细菌、反硝化细菌和硝化细菌在石油污染土壤生物修复过程中的演变情况,研究者利用实时定量PCR技术对其相关功能基因nifH、narG和amoA进行检测,再利用标准曲线计算获得基因的绝对拷贝数。此类研究可以表明结果表明氮循环功能基因的动态监测可以从基因和物种水平上反映土壤修复的效果,为土壤修复的监控和效果评估提供参考。


    1、实时监测:通过扩增曲线能够实时监测PCR产物的积累。

    2、特异性强:实验完成后,溶解曲线的分析可以验证扩增产物的特异性,降低假阳性。

    3、精确定量:利用扩增进入指数增长期的CT值来定量测定起始模板量,从而实现了极为精确的核酸定量检测。可以十分方便的知道目的基因的含量。



1. 技术重复质量评估分析;

2. 绝对量计算

 公式(copies/µl)=[质粒浓度(ng/ul)×10-9×6.02×1023] / [ 克隆产物碱基数×660(g/mol)]

 载体(pMD 18-T)碱基数 = 2692 bp

3. 对于有生物学重复的检测,计算SD和p-value。

 


(一)样品类型

  1. 总DNA;样品浓度:≥10 ng/ul;样品总量:>1ug;样品纯度: OD260/280为1.8~2.2,OD260/230≥1.0,260nm处有正常峰值。RNA完整性: 电泳检测28S/18S≥1.5。

  2. 组织:样品取样后立即液氮速冻,保存于液氮或超低温冰箱中。请尽量使用新制备的样品且样品量至少满足3次以上提取;

 

飞凡检测质检报告流程

1、 提供产品资料

2、 工程师根据您品资料的产品推荐合适检测项目,并给出报价

3、 确认报价没有问题,然后把样品送到我们实验室

4、 支付检测费用,安排检测

5、检测完成,出具检测报告,邮寄给客户

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关于飞凡



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飞凡检测致力于打造国内专业的第三方检测服务公司,不断优化整合市场检测资源,飞凡检测与多家科研院所,如上海同济大学,苏州大学,SGS,TUV,以及国内众多知名的检测公司进行深度合作,共同为国内制造业服务,为中国的制造业开拓海外市场保驾护航,为我们日常生活的健康安全树立标杆;公司目前工程师百余人,95%以上是本科以上学历;我们合作的实验室通过CNAS,CMA(EZ),所出具的任何一张报告都有CNAS,CMA资质,确保出具的每份报告都具有权威的法律效力。



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(二)样本运输

  1. 样本取样后置于冻存管中并标注,使用足量的干冰运输,并且尽量选用较快的邮递方式,以降低运输过程中样品降解的可能性。