鉴定microRNA（miRNA）调控的靶基因是阐释miRNA复杂调控机制的关键。在生物体内，miRNA除了抑制mRNA的翻译外，也会诱导mRNA被剪切降解，从而调控基因表达，发挥生物学功能。相比于动物，在植物中miRNA诱导基因剪切降解的方式会更为普遍。

        降解组测序（Degradome Sequencing）主要针对miRNA介导的剪切降解片段进行深度测序，从实验中筛选miRNA作用的靶基因，并结合生物信息学分析优势，确定降解片段与miRNA精确的配对信息。

        该技术既摆脱了仅利用生物信息学预测靶基因带来的高假阳性，又避免了常规靶基因鉴定手段（如5’ RACE）低通量耗时耗力的不足，显著促进了miRNA的功能研究。且能从细胞或组织中准确高效地筛选出miRNA的靶基因，为研究miRNA与其对应的靶基因的相互关系提供准确、高效的筛选手段。

    1. 质检文件：样本质检报告和质控报告；

    2. 测序数据质量评估；

    3. 鉴定mRNA降解片段；

    4. 降解组密度文件（Degradome Density File）的生成；

    5. miRNA靶基因生物信息学预测；

    6. miRNA靶基因的实验性确认；

    7. t-plot构建；

    8. 多样本的miRNA靶基因的比较分析（两个及以上样本有此分析内容）。

    1. 高通量：一次测序可鉴定得到1千万条以上的miRNA作用的靶基因序列信息，可充分覆盖该物种中的所有mRNA降解片段；

    2. 高准确性：可实现从几个到几十万个拷贝的精确计数，提供Q30以上数据，确保数据分析的准确性；

    3. 高分辨率：可精确检测到单碱基差异；

    4. 重复性好：深度测序保证了检测的随机性，背景噪音低，不需要技术的重复；

    5. 全方位服务：提供miRNA鉴定、靶基因筛选等研究的一站式解决方案。

（一）样品类型

　　1. 总RNA：样品浓度≥200 ng/µl，样品总量≥30 µg；样品纯度： OD260/280为1.8~2.2，OD260/230≥1.0，260 nm处有正常峰值。RNA完整性： 电泳检测28S/18S≥1.5。

　　2. 组织：植物组织样品取样后用锡箔纸包裹并标注，立即液氮速冻，保存于液氮或超低温冰箱中；动物组织、细胞或菌体取样后置于冻存管中并标注，立即液氮速冻，保存于液氮或超低温冰箱中。请尽量使用新制备的样品且样品量至少满足3次以上提取（普通样品0.6g以上，RNA含量少的花、果实等组织需要加量送）；

（二）样本运输

　　1. 总RNA样品请溶于RNase-free H2O或乙醇中，置于1.5 ml RNase-free离心管中，管上注明样品名称、浓度以及制备时间，管口使用Parafilm封口，干冰运输；

　　2. 植物组织、动物组织、细胞或菌体取样后置于冻存管中并标注，使用足量的干冰运输，并且尽量选用较快的邮递方式，以降低运输过程中样品降解的可能性。