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labelfree蛋白质组学的质谱检测

作者:小编 更新时间:2022-08-01 点击数:

  Label-free:无标签标记的定量蛋白质组学研究通过液质联用技术对蛋白质酶解肽段进行质谱分析,无需使用昂贵的稳定同位素标签做内部标准,只需分析大规模鉴定蛋白质时所产生的质谱数据,比较不同样品中相应肽段的信号强度,从而对肽段对应的蛋白质进行相对定量。

        依赖于繁杂的信息分析完成定量过程,主要有两种:信号强度和谱图计数法。前者根据一级质谱相关的肽段峰强度(Mass spectral peak intensity)、峰面积(Peak area)、液相色谱保留时间(LC retention time)等信息进行定量分析;后者根据二级质谱相关的每个蛋白鉴定到的肽段总次数(Peptide hide或Spectral counts)、所鉴定肽段的离子价位(Ion counts of identified peptides)等信息进行定量分析。


1、数据产出统计

2、蛋白质鉴定结果

3、蛋白质定量结果

4、蛋白质GO分析

5、蛋白质COG分析

6、蛋白质Pathway代谢通路分析

7、差异蛋白GO富集分析

8、差异蛋白的Pathway富集分析


1、待检测蛋白要求:完整无明显降解的总蛋白,蛋白量最低300ug,浓度最低为5ug/ul;蛋白提取试剂要求使用普通的组织、细胞裂解液即可,切忌不要使用二维电泳试剂提取;

2、直接提供组织或细胞,细胞样品,细胞量>107;组织样品,动物、微生物组织湿重>10mg;植物鲜嫩组织>100mg;体液样品,血液体积>500μl,后续操作全部由天科生物来做,您只需要提供样本,其他试剂都无需提供。

3、蛋白运输:24小时内可以4度运输;

4、蛋白长期保存:-20℃

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