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基因/miRNA表达水平分析验证

作者:admin 更新时间:2022-08-01 点击数:

  定量PCR(即时聚合酶链锁反应,Real-time Polymerase Chain Reaction,简称 Real-time PCR、即时PCR),又称定量即时聚合酶链锁反应(Quantitative real time polymerase chain reaction,简称即时定量PCR)。定量PCR技术是指以外参或内参为标准,通过对PCR终产物的分析或PCR过程的监测,进行PCR起始模板量的定量。该技术可以准确的检测基因的相对表达量和绝对表达量,被广泛地应用与基因表达水平的研究。同时,它也作为一些组学技术的验证,比如转录组测序、表达芯片等实验结果验证。


1. 技术重复质量评估分析;

2. Ct值计算

 △Ct(Treated)= CT(Treated_gene A)-CT(Treated_housekeeping gene)

 △Ct(Control)= CT(Control_gene A)-CT(Control_ housekeeping gene)

 △△Ct=△Ct(Treated)-△Ct(Control)

3. 对于有生物学重复的检测,计算SD和p-value。

 


与RT-PCR相比,荧光定量PCR具有以下技术优势:

1、实时监测:通过扩增曲线能够实时监测PCR产物的积累。

2、特异性强:实验完成后,溶解曲线的分析可以验证扩增产物的特异性,降低假阳性。

3、精确定量:利用扩增进入指数增长期的CT值来定量测定起始模板量,从而实现了极为精确的核酸定量检测。



(一)样品类型

  1. 总RNA;样品浓度:≥250 ng/ul;样品总量:>5ug;样品纯度: OD260/280为1.8~2.2,OD260/230≥1.0,260nm处有正常峰值。RNA完整性: 电泳检测28S/18S≥1.5。

  2. 组织:样品取样后立即液氮速冻,保存于液氮或超低温冰箱中。请尽量使用新制备的样品且样品量至少满足3次以上提取;

 

(二)样本运输

  1. 总RNA样品请溶于RNase-free H2O或乙醇中,置于1.5 ml RNase-free离心管中,管上注明样品名称、浓度以及制备时间,管口使用Parafilm封口,干冰运输;

  2. 样本取样后置于冻存管中并标注,使用足量的干冰运输,并且尽量选用较快的邮递方式,以降低运输过程中样品降解的可能性。


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