1. 基因组组分分析：编码基因预测和注释、功能分类；重复序列预测；非编码RNA注释，包括tRNA，rRNA，sRNA等；

    2. 基因岛预测：行使相同功能的基因聚集成簇，包括毒力岛、抗性岛、抗生素岛等；

    3. 前噬菌体：可整合进基因组的噬菌体序列，常会带来功能基因；

    4. CRISPR：与细菌免疫相关，抵御外来DNA序列；

    5. 假基因分析：一般是进化过程中失活的基因冗余拷贝；

    6. 进化分析。

图：前噬菌体预测

　　本平台采用的是第二条技术路线，单分子测序（第三代测序技术）平均读长达到10Kb，基本可以不受重复序列的影响，同时它的建库无需PCR过程以及测序原理的原因帮助它又很好的克服了GC偏移的影响。三代测序结合二代测序大大提高了测序的效率，基本可在60个工作日内获得完成图已经相关的信息分析。

（一）样品类型

　　1. DNA；样品浓度：≥50 ng/ul；样品总量：>30ug；样品纯度： OD260/280为1.8~2.2，OD260/230≥1.0。

　　2. 菌体取样后置于冻存管中并标注，立即液氮速冻，保存于超低温冰箱中。请尽量使用新制备的样品且样品量至少满足3次以上提取。

（二）样本运输

　　1.DNA样品置于1.5 ml RNase-free离心管中，管上注明样品名称、浓度以及制备时间，管口使用Parafilm封口，干冰运输；

　　2.菌体取样后置于冻存管中并标注，使用足量的干冰运输，并且尽量选用较快的邮递方式，以降低运输过程中样品降解的可能性。