1、原始数据产出统计；

2、与基因组比对（需甲方提供参考基因组信息，如hg19）；

3、比上的Reads在基因组各区域的分布;

4、Reads相对TSS(transcript start site)、TTS(transcript terminal site)的depth分布;

5、全基因组Peak Calling；

6、基因组上检测到的Peak统计分布（峰数目，峰间距，峰宽度等）；

7、每个样本的检测到的Peak在基因组各区域的分布情况；

8、提供与样本Peaks相关的基因列表；

9、Peaks相关基因Gene Ontology功能分类；

10、Case 相对control的差异peaks及其相关基因差异统计；

1. 通量高

2. 分辨率高，精确到单碱基水平

3. 能发现已知启动子以外的结合区域

1、需提供至少2ng 样品起始量的ChIP-seq建库产品，要求ChIP片段长度200-500bp，为保证实验质量及延续性，请一次提供至少2次样本制备的量；

2、样品浓度和纯度：基因组DNA样品浓度>0.5ng/μl；OD260/280介于1.8-2.0，无肉眼可见污染；

3、样品保存：请选择乙醇、纯水进行保存，并在样品信息单中注明；

4、样品运输：请将样品置于1.5ml管中，并用封口膜封好。

研究背景

鉴定转录因子的靶基因，对于揭示生物体中的调控网络非常重要。干旱是植物常见逆境胁迫的一种，本研究目的是精确解析植物干旱耐受相关转录因子ASR1调控的基因座位点。ASR1是植物界（拟南芥除外）独有的调节因子，可缓解缺水引起的胁迫。但是ASR1的靶基因仍然不清楚，本文检测西红柿中与ASR1蛋白虎作的特殊基因座位点。

研究方法

采用高质量的anti-ASR1抗体，通过CHIP沉淀西红柿叶片中的DNA、序列，然后进行高通量的DNA测序分析。

研究结果

1.鉴定到新的靶基因库，其中一些基因明确参与干旱胁迫响应；

2.ASR1富集到的一些基因，编码细胞壁合成相关蛋白和水通道蛋白；

3.鉴定到超强一致性的ASR1互作DNA元件。

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